植物的遗传多样性，环境适应性和植物基因家族的演化；1. 应用核基因组和叶绿体基因组的序列多态性探索不同植物类群的系统发育关系；2. 综合利用遗传学、生理生化和分子生物学等方法研究植物关键创新性状的产生、植物对不同环境适应的自然分化、分子机理和演化机制；3. 结合序列分析和分子功能等多个角度研究植物环境适应相关的基因家族的演化。

刘利荣,李艳春,GENG-SHEN WANG,LIU-KUN JIA,康菊清,ZHU-LIANG YANG,Type studies on two Paxillus species (Paxillaceae, Boletales) described from China:Phytotaxa,2022.1.10,530(2):177–188

张文晶,康菊清,杨晓萌,高侃,魏欣仪,石雪彤,王瑞瑄,武凤霞,十字花科植物中ABA相关蛋白ABI4的序列演化 与转录激活活性分析:植物学报,2021.8.9,56(6):doi: 10.11983/CBB21036

康菊清,张小卉,薛成,耿方东,黄蕾,任毅,耧斗菜属长果耧斗菜在陕西省的新分布:西北植物学报,2021.8.1,41(8):1437-1438

薛成,任毅,耿方东,张晓燕,常小鹏,黄蕾,张建强,Morphological variation pattern of Aquilegia ecalcarata and its relatives:Journal of Systematics and Evolution,2020.6.6,58(3):221-233

Xiaojing Dong,Jigang Li,Hong Li,Dun Zhang,Lijuan Qi,Run Han,Shaoman Zhang,Yangyang Zhou,Xiaoji Wang,Shuhua Yang,William Terzaghi,Hongya Gu,Dingming Kang,Yuxin Jia,Jinkui Cheng,Yihao Shi,Yan Yan,Bochen Jiang,Yiting Shi,The cold response regulator CBF1 promotes Arabidopsis hypocotyl growth at ambient temperatures:The EMBO Journal,2020.5.25,39:e103630

张雨曲,任毅,周云,候晓琪,黄蕾,张建强,Phylogeny of Fargesia (Poaceae: Bambusoideae) and infrageneric adaptive divergence inferred from three cpDNA and nrITS sequence data:Plant Systematics and Evolution,2019.1.5,305(1):61-75

华北耧斗菜花色变异的转录组学研究,陕西省科技厅

特意响应环境冷信号的DREB1/CBF类基因在十字花科植物中的演化及其抗冷功能的分化,国家自然科学基金委

基于核基因片段多态性的华北耧斗菜复合体系统发育研究,陕西省科学技术厅

特异响应冷胁迫的DREB1/CBF基因亚家族在陆生植物中的演化